平成11年度に入って，「 日本技術者教育認定機構 (Japan Accreditation Board for Engineering Education)」が，文部省，通産省等の政府機関並びに 経団連を始めとする産業界の支援を得て平成11年10月の設立を目指すこととなり， 「JABEE設立準備室」を組織して，急遽我が国としての技術者教育認定制度の 確立に向けた各種の取りまとめ作業に入ることとなりました。
この動きを受けて，電気学会においても 電気系分野における「技術者教育認定制度」の「評価システム(評価基準の 作成，評価方法の検討，審査委員の養成)」の構築に協力して行く必要があるため， 平成11年9月に前委員会の体制を強化した「技術者教育認定制度検討委員会」に改組しました。 その後，平成11年11月19日に設立総会が行われ，JABEEが正式に発足すると同時に， 電気学会はJABEEにおける電気系分野の中核学協会として参画しております。
JABEEの認定審査が定常的な状態に移行したことを受けて， 平成16年4月より電気学会内部の技術者教育関係の組織を改組し，技術者教育委員会を立ち上げました。 この改組により，JABEEに関する業務は， 技術者教育委員会の傘下にあるJABEE審査実行部会とJABEE普及支援部会が担うことととなりました。